藿香正气丸主要用于解表化湿、理气和中，对暑湿感冒、胃肠型感冒、呕吐泄泻、胸膈痞闷等症状有缓解作用。
藿香正气丸含有藿香、紫苏等成分，能发散风寒湿邪，适用于夏季贪凉饮冷或感暑受湿导致的恶寒发热、头痛胸闷。暑湿感冒患者可能出现低热不退、周身酸沉等症状，与风寒感冒不同，此时服用该药可帮助发汗解表。
方中白术、茯苓能健脾渗湿，陈皮、厚朴可理气宽中，对于湿浊中阻引起的脘腹胀满、恶心呕吐效果显著。胃肠型感冒或饮食不节导致的消化不良，伴随舌苔白腻时适宜使用，但需与急性胃肠炎相鉴别。
半夏、白芷等成分具有温中止泻作用，能改善寒湿型腹泻伴随便溏不爽、肠鸣腹痛的情况。对于水土不服或空调受凉引起的非感染性腹泻，可配合腹部热敷协同缓解症状。
桔梗、大腹皮等药材能宣畅气机，针对湿阻气滞导致的胸膈痞闷、嗳气频作有疏导作用。情绪郁结加重症状时可配合穴位按压，但需排除心脑血管疾病等器质性病变。
现代研究表明，广藿香醇等成分对金黄色葡萄球菌、痢疾杆菌有一定抑制作用，可辅助改善肠道菌群紊乱。但细菌性痢疾等感染性疾病仍需联合抗生素治疗。
使用藿香正气丸期间应忌食生冷油腻，服药三天症状未缓解或出现高热脱水需及时就医。湿热体质或糖尿病患者慎用，与头孢类抗生素合用可能引发双硫仑样反应。夏季可备该药用于应急，但不宜作为长期调理用药。
