防风通圣丸适用人群主要有外感风寒兼内热表里俱实的患者、存在风疹湿疹等皮肤瘙痒症状者、荨麻疹或过敏性皮炎患者、肥胖伴有便秘倾向的痰湿体质人群、以及部分高血压初期的肝阳上亢型患者。
适用于风寒束表郁而化热导致的恶寒发热头痛咽痛等症状。这类人群通常存在鼻塞流涕与口干便秘并见的矛盾表现，病机符合中医表寒里热证型。该方能解表通里双解，使用时需注意表证未解时不宜单用清热药，当与辛温解表药配伍。
对风邪夹湿引起的风疹湿疹等皮肤病有缓解作用。方中防风荆芥祛风止痒，大黄芒硝泄热通便，通过清利肠道减轻皮肤变态反应。临床可见皮损色红渗液伴大便干结者较适宜，但脾胃虚寒型荨麻疹慎用。
荨麻疹或过敏性皮炎属风热蕴肤证时可用。该方能抑制组胺释放改善皮肤血管通透性，对食物过敏或花粉症引发的皮肤肿胀瘙痒有缓解作用，但不适用于过敏性休克等急重症。
针对体型肥胖伴排便困难者，通过大黄滑石等成分涤荡肠胃积滞。此类患者多见舌苔厚腻腹型肥胖，药物通下作用可能带来短期体重下降，但须配合饮食运动干预才能维持效果。
初期表现为头痛目赤烦躁便秘的高血压患者，符合中医肝火上炎证候时可短期应用。方中栀子黄芩能清肝泄火，但血压波动较大或合并心肾功能损害者需谨慎。
使用防风通圣丸期间应忌食辛辣油腻，体质虚弱或便溏者不宜长期服用。该方含麻黄高血压患者使用时需监测血压，服药后出现心悸或腹泻应减量。儿童孕妇及哺乳期妇女须在中医师指导下使用，皮肤过敏症状持续不缓解或伴发热时应及时就医。风寒感冒无内热症状或纯虚寒体质者禁用，糖尿病患者需注意丸剂中的蜂蜜含量。
