3个月宝宝呼吸系统发育尚不完善，不宜趴着睡较长时间，建议定期更换姿势，所以3个月宝宝趴着睡4个小时可能会有影响。具体分析如下：

1、怎么办：通常宝宝的颈部力量通常较小，无法自行翻身。建议家长尽量避免让宝宝趴着睡，如果要趴着睡，也需要半个小时帮助宝宝更换睡觉姿势，以免对宝宝的呼吸器官和骨骼造成压迫。日常生活中，通常建议让宝宝使用平躺的方式睡觉。

2、有影响吗：3个月宝宝的身体通常较为脆弱，呼吸器官和其他相关器官可能尚未发育完全。如果趴着睡的时间过长，可能会影响宝宝正常呼吸，导致宝宝呼吸不畅。此外，还可能会压迫宝宝的胃部，造成胃肠道不适，出现消化不良、食欲不振、吐奶等症状。趴着睡4个小时属于较长的时间，可能对宝宝产生影响。

需要注意的是，3个月的宝宝颈部尚未发育完成，颈背部是呈一条直线的。建议不要给宝宝使用枕头，以免导致出现驼背、脊柱侧凸的情况。如果宝宝在趴着睡后出现了相应的不适症状，家长需要及时带其就医，以免耽误治疗时机。