皮下囊肿的治疗药物主要包括抗生素类、抗炎类和外用消毒类药物。常用药物有头孢氨苄胶囊、阿莫西林克拉维酸钾片、莫匹罗星软膏等，具体用药需根据囊肿是否合并感染由医生评估决定。
功能主治：适用于敏感菌所致的急性扁桃体炎、咽峡炎、中耳炎、鼻窦炎、支气管炎、肺炎等呼吸道感染、尿路感染及皮肤软组织感染等。本品为口服制剂，不宜用于重症感染。
用法用量：成人剂量:口服。一般一次250～500mg，一日4次，高剂量一日4g。肾功能减退的患者，应根据肾功能减退的程度，减量用药。单纯性膀胱炎﹑皮肤软组织感染及链球菌咽峡炎患者每12小时500mg。 儿童剂量:口服。每日按体重25～50mg/kg，一日4次。 皮肤软组织感染及链球菌咽峡炎患者每12小时口服12.5～50mg/kg。
抗生素类药物适用于合并细菌感染的皮下囊肿。头孢氨苄胶囊通过抑制细菌细胞壁合成发挥杀菌作用，对金黄色葡萄球菌等常见皮肤感染菌有效。阿莫西林克拉维酸钾片是广谱抗生素，克拉维酸成分可增强对产酶菌的抗菌活性。使用这类药物需注意过敏史，肝功能异常者需调整剂量。
抗炎药物可缓解囊肿周围组织的炎症反应。泼尼松片作为糖皮质激素，能减轻红肿热痛症状，但不宜长期使用。塞来昔布胶囊是非甾体抗炎药，通过抑制前列腺素合成发挥抗炎镇痛作用，胃肠道不良反应相对较小。
外用药物主要用于未破溃的囊肿辅助治疗。莫匹罗星软膏是局部抗生素，对革兰阳性菌有高度活性。碘伏溶液可消毒皮肤表面，减少继发感染风险。鱼石脂软膏具有温和刺激作用，可促进囊肿内容物吸收。使用外用药前需清洁患处，破损皮肤避免使用刺激性制剂。
体积较大或反复发作的皮下囊肿可能需要手术切除。术前可使用上述药物控制感染，术后可能需继续用药预防感染。药物治疗期间应保持患处清洁干燥，避免挤压囊肿。若用药后出现皮疹、呼吸困难等过敏反应，或囊肿持续增大伴发热，应立即就医。
