电子肠镜检查过程中可能出现轻微不适，但多数患者可以耐受。检查前肠道准备、检查中操作手法、个体敏感度差异、肠腔弯曲程度、医生经验水平等因素均会影响体验感受。
电子肠镜检查的不适感主要来源于肠镜通过肠道弯曲部位时的牵拉感，以及注气扩张肠腔带来的腹胀。现代肠镜管径较细且材质柔软，配合医生熟练操作可大幅降低疼痛概率。检查前服用解痉药物能减少肠道蠕动带来的不适，静脉麻醉下的无痛肠镜则能实现完全无感。部分患者术后可能出现短暂腹胀或肛门不适，通常1-2小时内自行缓解。
少数肠道结构异常或既往有腹部手术史的患者，可能因肠粘连导致检查难度增加。炎症性肠病活动期、肠管狭窄等病变部位通过时可能引发较明显疼痛。极度紧张或痛阈较低的患者可选择无痛肠镜，通过丙泊酚等麻醉药物实现睡眠状态下完成检查。检查过程中出现持续剧烈腹痛需立即告知可能存在肠穿孔等罕见并发症。
建议检查前3天开始低渣饮食，前一天严格按医嘱服用清肠药物，确保肠道清洁度达标可缩短操作时间。检查后2小时内禁食，待麻醉完全消退后从流质饮食逐渐过渡。术后24小时避免驾驶或高空作业，出现持续腹痛、便血等症状需及时就医。定期进行肠镜检查是结直肠癌筛查的重要手段，40岁以上人群建议每5-10年检查一次。
