清气化痰丸可以治疗因痰热壅肺、痰湿阻滞等引起的咳嗽、痰多色黄黏稠、胸闷气促等症状。主要用于慢性支气管炎急性发作、肺炎、支气管扩张等呼吸系统疾病，也可辅助治疗痰热扰神导致的失眠烦躁。
慢性支气管炎急性发作期出现咳嗽加重、咯黄脓痰时，清气化痰丸可缓解痰热壅肺症状。其成分黄芩、瓜蒌仁能清热化痰，陈皮、茯苓可健脾化湿。伴随喘息可联用氨溴索口服液、多索茶碱片等支气管扩张剂，但须在医生指导下使用。
肺炎早期出现发热、痰黄黏稠时，可作为辅助用药配合抗生素治疗。方中半夏、杏仁有化痰平喘之效，适用于肺部听诊有湿啰音者。若出现高热不退或血痰，需及时联用左氧氟沙星片、头孢克肟分散片等抗感染药物。
对支气管扩张症合并感染时的痰液黏稠、咯吐不畅有改善作用。含有的胆南星能稀释痰液，枳实可行气消胀。但反复咯血者需禁用，建议配合乙酰半胱氨酸颗粒、桉柠蒎肠溶软胶囊等黏液溶解剂。
针对痰热内扰所致的入睡困难、心烦胸闷，可通过清化热痰改善症状。常与朱砂安神丸配伍使用，舌苔黄腻者更为适宜。需注意本方不适用于阴虚火旺型失眠。
儿童外感后咳嗽痰黄、喉间痰鸣时，可减量使用。但家长需观察患儿是否出现腹泻等不良反应，且不可与镇咳药如右美沙芬糖浆同服。若持续发热或呼吸急促，应立即就医。
使用清气化痰丸期间应忌食辛辣油腻，避免加重痰湿。服药3天后症状未缓解需停用并就诊，老年体弱者需调整剂量。慢性呼吸系统疾病患者建议定期复查肺功能，配合呼吸训练。痰多者可适当饮水稀释痰液，保持室内空气流通，避免接触刺激性气体。
