咳嗽吃益生菌作用不大，咳嗽时需对症应用抗感染、抗过敏、止咳化痰药物等进行治疗。
咳嗽大多是因为呼吸道有炎性感染，使粘膜充血、水肿，或呼吸道受到刺激，处在高反应状态，平滑肌收缩痉挛引起的。需针对病因，合理应用抗感染、抗过敏的药物治疗，如用阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒、、利巴韦林片等抗生素或抗病毒药物抗感染，或应用盐酸西替利嗪片、马来酸氯苯那敏片、盐酸氮卓斯汀片等药物抗过敏，必要时服用感冒止咳颗粒、咳喘宁颗粒、盐酸氨溴索片等药物止咳化痰，才能使咳嗽尽快缓解。
虽然益生菌能提高机体免疫力，但益生菌主要是调节肠胃功能，使肠胃系统菌群平衡衡的活性微生物，当消化不良、腹泻、腹痛时吃益生菌调理效果较好，咳嗽时吃益生菌并没有明显的疗效。
