经常腹泻时服用益生菌可能有效，但需结合具体病因判断。腹泻可分为感染性腹泻、功能性腹泻、炎症性肠病等多种类型，益生菌主要适用于肠道菌群紊乱相关腹泻。
益生菌对以下三类腹泻具有明确调节作用：肠道菌群失调性腹泻，常见于抗生素使用后，补充双歧杆菌、酪酸梭菌等可恢复微生态平衡；旅行者腹泻，提前服用布拉氏酵母菌能降低50%发病率；乳糖不耐受腹泻，嗜酸乳杆菌可辅助分解乳糖。临床常用益生菌包括双歧杆菌三联活菌、地衣芽孢杆菌、枯草杆菌二联活菌等。
病毒性腹泻急性期如轮状病毒感染建议使用布拉氏酵母菌，其能缩短病程1-2天。慢性腹泻伴随肠易激综合征时，持续服用鼠李糖乳杆菌8周可改善腹胀症状。但需注意，严重免疫缺陷患者、中心静脉导管留置者禁用活菌制剂。
对于细菌性痢疾等感染性腹泻，需优先进行病原学治疗。若腹泻持续超过2周或出现血便、发热等症状，应及时就医排查克罗恩病、溃疡性结肠炎等器质性疾病。日常可配合低FODMAP饮食，避免洋葱、豆类等产气食物。
选择益生菌时应注意菌株特异性，不同菌株对应不同适应症。储存时需避光防潮，部分制剂要求2-8℃冷藏。与抗生素联用时需间隔2小时以上，服用温水温度不宜超过40℃。
