尖锐湿疣的治疗通常需要综合方案，药物治疗是重要组成部分，但不存在单一的“最好”用药，需在医生指导下根据疣体大小、部位和数量选择，常用药物主要有咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊、氟尿嘧啶乳膏、干扰素凝胶以及三氯醋酸溶液。
一、咪喹莫特乳膏
咪喹莫特乳膏是一种免疫调节剂，通过刺激局部产生免疫反应来清除人乳头瘤病毒和疣体。它适用于治疗外生殖器和肛周直径较小的尖锐湿疣，尤其对于表面平坦、范围不大的疣体效果较好。使用后常见局部皮肤出现红斑、水肿、糜烂等反应，这属于药物起效的表现，但应避免用于破损皮肤。该药物为处方药，须严格遵医嘱使用，通常需连续用药数周。
二、鬼臼毒素酊
鬼臼毒素酊属于细胞毒性药物，能够抑制疣体细胞分裂，使其坏死、脱落。它对于单个、菜花状或乳头状的小型尖锐湿疣有较好效果，常用于男性包皮、龟头及女性外阴部位。使用时需用特制塑料签精确涂药，避免接触周围正常皮肤，以免引起灼伤、疼痛。该药物刺激性较强，不建议用于黏膜部位或面积过大的疣体，且孕妇禁用。
三、氟尿嘧啶乳膏
氟尿嘧啶乳膏是一种抗代谢类药物，能干扰疣体细胞的DNA合成，从而抑制其生长。它可用于治疗尿道口、阴道内等特殊部位的尖锐湿疣，对于多发性、面积较大的疣体也有一定作用。使用后可能出现局部疼痛、溃疡、色素沉着等不良反应。由于该药可能被吸收进入血液循环，有致畸风险，育龄期女性使用需格外谨慎，必须在医生严密指导下进行。
四、干扰素凝胶
干扰素凝胶具有抗病毒和免疫调节双重作用，能直接抑制人乳头瘤病毒复制，增强局部细胞免疫功能。它常作为物理治疗或手术切除后的辅助用药，用于降低复发率，也可用于治疗亚临床感染或预防复发。该药局部刺激性相对较小，但起效较慢，需长期坚持使用。部分患者使用后可能出现流感样症状，如低热、乏力，通常可自行缓解。
五、三氯醋酸溶液
三氯醋酸溶液是一种化学腐蚀剂，通过使疣体蛋白凝固、坏死而达到去除目的。它由医生操作，点涂于疣体表面，适用于体积较小、质地较硬的尖锐湿疣，尤其适用于妊娠期妇女（在其他药物受限时）。治疗时需精确控制用量和范围，一次处理面积不宜过大，以免造成深度灼伤和疤痕。治疗后需保持局部干燥，避免感染。
尖锐湿疣的药物治疗必须由专业医生评估后选择，患者不可自行购药使用。治疗期间应保持患处清洁干燥，穿着宽松透气的棉质内衣，避免搔抓，以防自身接种扩散。饮食上宜清淡，多摄入富含优质蛋白和维生素的食物，如鸡蛋、鱼肉、西蓝花等，避免辛辣刺激性食物及饮酒。同时，应告知性伴侣进行检查，治疗期间避免性生活，使用安全套也不能完全防止病毒传播。定期复查至关重要，即使疣体清除，病毒仍可能潜伏，需观察是否有复发迹象。保持良好心态，积极配合医生完成全程治疗和随访，是战胜疾病的关键。
