清瘟解毒丸具有清热解毒、祛湿退热的功效，主要用于风热感冒、流行性感冒、痄腮等病症。其主要功效有解表清热、消肿止痛、祛风除湿、抑制病毒、调节免疫等。
清瘟解毒丸中的连翘、金银花等成分具有发散风热的作用，可缓解发热头痛、咽喉肿痛等外感风热症状。对于因风热袭表导致的鼻塞流黄涕、咳嗽痰黄等症状有显著改善效果。
该药含有的板蓝根、蒲公英等能减轻局部炎症反应，尤其对痄腮引起的腮腺肿痛、扁桃体化脓等症状疗效明确。其抗炎作用可降低前列腺素等致痛物质的释放。
黄芩、栀子等成分能清除体内湿热邪气，改善湿热内蕴导致的头身困重、关节酸痛。对夏季暑湿感冒伴恶心呕吐、腹泻等症状具有调节作用。
体外实验表明其成分对流感病毒、呼吸道合胞病毒等有抑制作用，可通过干扰病毒复制缓解病毒感染症状。在流行性感冒早期服用可缩短病程。
该方可促进淋巴细胞增殖，增强巨噬细胞吞噬能力，提高机体抗病能力。对反复呼吸道感染人群可发挥扶正祛邪的功效。
使用清瘟解毒丸期间应忌食辛辣油腻，避免加重内热。服药后出现恶心、腹泻等胃肠不适可减量服用。风热感冒患者用药期间需保持室内空气流通，适量饮用温水有助于发汗解表。流感高发季节可连服3-5天作为预防，但长期使用须遵医嘱。服药后症状未缓解或出现高热持续不退、意识模糊等严重情况时需立即就医。
