自身免疫性肝炎的确诊需要结合临床表现、实验室检查和病理学评估。诊断主要依据国际自身免疫性肝炎小组IAIHG制定的评分系统，包括血清学标志物、肝组织活检和排除其他肝病。
血清学检测是诊断的重要环节。抗核抗体、抗平滑肌抗体和抗肝肾微粒体抗体是常见的自身抗体标志物。免疫球蛋白G水平升高也是典型特征。约80%患者会出现这些抗体中的一种或多种阳性。
肝组织活检对确诊具有决定性意义。病理学特征包括界面性肝炎、淋巴浆细胞浸润和肝细胞玫瑰花结样改变。活检还能评估肝脏纤维化程度，指导治疗方案选择。
排除其他肝病是诊断的必要条件。需通过病毒学检测排除乙肝、丙肝等感染性肝炎，通过影像学检查排除胆道梗阻或肿瘤，通过代谢指标排除威尔逊病或血色病等遗传性肝病。
临床表现对诊断有辅助价值。患者可能出现乏力、食欲减退、关节痛等非特异性症状，部分患者会出现黄疸或肝肿大。约25%患者确诊时已存在肝硬化表现。
对于疑似病例，建议尽早就诊消化内科或肝病专科。医生会根据个体情况制定检查方案，必要时进行肝穿刺活检。早期诊断和规范治疗可显著改善预后，延缓疾病进展。
