清艾条和药艾条主要通过成分、功效及适用人群进行区分。清艾条由纯艾叶制成，药艾条则在艾绒中添加了多种中药材。
清艾条仅含艾叶加工后的艾绒，质地均匀松散，燃烧时气味纯净。药艾条在艾绒中混合了桂枝、白芷、川芎等中药材，外观可见明显药物颗粒，燃烧时散发复合药香。常见药艾条配方包括雷火灸（含乳香、没药）、太乙灸（含麝香、硫磺）等。
清艾条侧重温经散寒，适用于风寒湿痹、宫寒痛经等寒证调理。药艾条因添加药物增强针对性，如含红花的药艾条擅长活血化瘀，含苍术的可健脾祛湿。雷火灸多用于骨关节疼痛，太乙灸常用于虚寒重症。
清艾条过敏风险较低，孕妇、儿童等特殊人群使用前仍需咨询医师。药艾条因含多种药材，过敏体质者需谨慎，如对其中某味中药过敏则禁用。阴虚火旺者不宜使用含附子、肉桂等热性药材的药艾条。
购买时观察艾条横截面：清艾条断面呈青黄色且质地均匀，药艾条可见彩色药粉颗粒。正规产品包装需标明成分，药艾条应注明具体添加药材及比例。治疗类病症建议在中医师指导下选择药艾条，养生保健可优先选用清艾条。
两者均需密封防潮保存，药艾条因含挥发性药材，开封后需尽快使用。清艾条保质期通常为3年，药艾条因药材活性成分易挥发，建议1年内使用完毕。储存时避免与樟脑丸等刺激性物品同放。
使用艾条前建议先进行小范围皮肤测试，艾灸时保持环境通风，每次灸疗时间控制在20分钟以内。艾灸后注意保暖避风，2小时内不宜洗澡。若出现皮肤红肿、头晕等不适，应立即停止并就医。日常保健每周艾灸2次即可，病症治疗需遵医嘱制定方案。
