长期或不规范使用阿莫西林胶囊可能会产生耐药性。阿莫西林胶囊属于青霉素类抗生素，细菌可能通过基因突变或获得耐药基因等方式降低药物敏感性。
功能主治：阿莫西林适用于敏感菌（不产β内酰胺酶菌株）所致的下列感染：
1.溶血链球菌、肺炎链球菌、葡萄球菌或流感嗜血杆菌所致中耳炎、鼻窦炎、咽炎、扁桃体炎等上呼吸道感染。
2.大肠埃希菌、奇异变形杆菌或粪肠球菌所致的泌尿生殖道感染。
3.溶血链球菌、葡萄球菌或大肠埃希菌所致的皮肤软组织感染。
4.溶血链球菌、肺炎链球菌、葡萄球菌或流感嗜血杆菌所致急性支气管炎、肺炎等下呼吸道感染。
5.急性单纯性淋病。
6.本品尚可用于治疗伤寒、伤寒带菌者及钩端螺旋体病；阿莫西林亦可与克拉霉素、兰索拉唑三联用药根除胃、十二指肠幽门螺杆菌，降低消化道溃疡复发率。
用法用量：1.成年人一次0.5g，每6～8小时1次，一日剂量不超过4g；2.小儿一日剂量按体重20～40mg/Kg，每8小时1次；3个月以下婴儿一日剂量按体重30mg/Kg，每12小时1次；3.肾功能严重损害患者需调整给药剂量，其中内生肌酐清除率为10～30ml/分钟 的患者每12小时0.25～0.5g；内生肌酐清除率小于10ml/分钟的患者每24小时0.25～0.5g。
细菌对阿莫西林胶囊产生耐药性主要通过两种机制。一是细菌产生β-内酰胺酶，这种酶能分解药物中的β-内酰胺环结构，使药物失效。二是细菌改变自身青霉素结合蛋白的结构，降低药物与靶点的结合能力。常见易产生耐药性的细菌包括金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌等。
部分情况下细菌对阿莫西林胶囊仍保持敏感性。对于未接触过抗生素或接触较少的细菌种群，药物通常能有效发挥作用。某些特定感染如A组链球菌引起的咽炎，目前全球范围内仍保持较高的敏感性。合理使用药物可延缓耐药性发展。
使用抗生素期间应严格遵医嘱完成全程治疗，避免自行增减剂量或提前停药。日常应加强手卫生管理，减少感染风险。出现感染症状时需通过病原学检查明确致病菌类型，根据药敏试验结果选择敏感抗生素。普通感冒等病毒感染无须使用抗生素。
