反流性食管炎在急性发作期或症状较重时西药效果较好，在慢性调理期或症状较轻时中药较好。
西药治疗反流性食管炎的优势在于起效迅速，能够快速抑制胃酸分泌，缓解烧心、反酸等剧烈不适，对于食管黏膜的急性损伤修复具有明确的针对性，适合需要立即控制病情的患者。中药治疗的优势在于整体调节，通过疏肝理气、和胃降逆等方法改善胃肠动力，调节人体阴阳平衡，减少疾病复发概率，适合长期体质调理及预防反复发作的患者。西药的劣势在于部分药物长期使用可能产生依赖性，停药后容易出现症状反弹，且可能伴随头痛、腹泻等不良反应，对肝肾功能不全者需谨慎使用。中药的劣势在于起效相对缓慢，难以在短时间内消除剧烈的炎症反应，且药材质量参差不齐，煎煮过程繁琐，若辨证不准可能导致药效不佳甚至加重胃肠负担。
患者应根据自身病情阶段选择治疗方案，急性期可优先选用西药控制症状，稳定期可结合中药巩固疗效，日常生活中需保持饮食清淡，避免暴饮暴食，饭后不要立即平卧，睡觉时适当抬高床头，戒烟限酒，保持心情舒畅，定期复查胃镜以监测食管黏膜恢复情况。
