苯扎溴铵酊可用于治疗皮肤黏膜感染、创面消毒及部分妇科炎症，主要针对化脓性皮肤病、浅表真菌感染及滴虫性阴道炎等疾病。该药物为外用消毒防腐剂，具有广谱抗菌作用，使用前需清洁患处并避免接触眼睛。
苯扎溴铵酊适用于金黄色葡萄球菌、链球菌等引起的化脓性皮肤病，如毛囊炎、疖肿等。其阳离子表面活性剂成分能破坏细菌细胞膜，达到杀菌效果。使用时可直接涂抹于患处，但皮肤破损面积较大或合并全身症状时需及时就医。治疗期间可能出现局部刺激，若发生过敏需停用。
对表皮癣菌引起的脚癣、股癣等浅表真菌感染有辅助治疗作用。酊剂剂型有助于药物渗透角质层，抑制真菌生长。需配合抗真菌药物如联苯苄唑乳膏使用，连续使用不超过2周。糖尿病患者或免疫功能低下者应谨慎使用，避免继发细菌感染。
稀释后可用于外阴及阴道冲洗，辅助治疗滴虫性阴道炎。通过改变滴虫生存环境的渗透压使其死亡，常与甲硝唑栓联合使用。使用前需将原液按说明书比例稀释，避免黏膜灼伤。妊娠期女性须在医生指导下使用，不可自行灌洗阴道。
小面积擦伤、烧伤及手术切口可用其预防创面感染。酊剂中乙醇成分能增强杀菌效果，但开放性伤口或深度烧伤禁用。消毒时需从创面中心向外周螺旋式擦拭，已化脓或坏死的创面需清创后再处理。合并慢性溃疡者应改用其他温和消毒剂。
可用于体温计、镊子等非侵入性器械的初步消毒。苯扎溴铵能有效灭活乙肝病毒等包膜病毒，但对芽孢无效。金属器械浸泡时间不宜超过30分钟，使用前需用无菌水冲洗。内窥镜等精密器械需采用戊二醛等专用消毒剂。
使用苯扎溴铵酊期间需保持患处清洁干燥，避免与其他外用消毒剂混用。皮肤敏感者可先在小面积试用，出现红肿脱屑需立即停用。治疗真菌感染时需同步对鞋袜等物品消毒，防止交叉感染。妇科用药期间禁止性生活，月经期暂停使用。该药物仅供外用，误服需立即就医洗胃。
