拨云退翳丸主要用于治疗肝经风热或肝火上炎引起的目赤肿痛、畏光流泪、翳膜遮睛等症状，常见于结膜炎、角膜炎、虹膜睫状体炎等眼表炎症性疾病。
一、结膜炎
由细菌或病毒感染引发的结膜充血、分泌物增多，可伴随异物感。拨云退翳丸中的黄芩、黄连等成分具有清热散风功效，适用于病毒性结膜炎早期。同类药物还可选择盐酸左氧氟沙星滴眼液、更昔洛韦眼用凝胶等，但须在医生指导下联用抗生素或抗病毒药物控制感染。
二、角膜炎
角膜上皮受损出现的疼痛、视物模糊，多与微生物感染或外伤相关。该药通过菊花、密蒙花等成分辅助缓解刺激症状，但需联合重组牛碱性成纤维细胞生长因子滴眼液促进修复，真菌性角膜炎患者禁用本品。
三、虹膜睫状体炎
前葡萄膜炎症导致的瞳孔缩小、睫状压痛，多与自身免疫异常有关。拨云退翳丸可辅助减轻畏光症状，急性期需配合醋酸泼尼松龙滴眼液等糖皮质激素类药物控制炎症反应。
四、睑缘炎
睑缘慢性炎症引发的灼热感、睫毛脱落，该药可改善局部充血状态，但需联用妥布霉素地塞米松眼膏控制细菌繁殖，脂溢性睑缘炎患者应同步进行眼睑清洁护理。
五、翼状胬肉
结膜增生侵入角膜引起的异物感，在充血进展期可用本品缓解症状，静止期或已影响视力者需考虑胬肉切除联合角膜缘干细胞移植术。
使用拨云退翳丸期间应避免辛辣刺激饮食，减少电子产品使用时间，出现视力骤降、剧烈眼痛或持续用药三天未见改善时需立即停用并就医。该药属于中成药制剂，对过敏性结膜炎、青光眼等非适应证疾病无效，糖尿病患者慎用丸剂剂型，长期使用可能引起胃肠不适。
