清热安宫丸主要治疗热闭神昏、烦躁不安、高热惊厥等症状，适用于中风闭证、流行性脑脊髓膜炎、脑出血等高热引起的神志异常疾病。
1、热闭神昏
清热安宫丸所含牛黄、麝香等成分能开窍醒神，对于高热导致的神志不清、谵妄躁动具有缓解作用。典型适应证包括重症感染、中暑等引起的中枢神经系统功能障碍，常伴随面赤气粗、牙关紧闭等症状。使用时应与其他清热解毒药物区分，该药侧重神识障碍的改善。
2、中风闭证
适用于脑卒中急性期痰热内闭证型，表现为突然昏倒、喉中痰鸣、肢体强痉。临床多用于出血性卒中早期辅助治疗，可配伍脱水降颅压药物使用。但需注意脑梗死患者应在溶栓时间窗外使用，避免与抗凝药物产生相互作用。
3、小儿高热惊厥
对儿童急性发热引发的抽搐有镇惊效果，尤其适用于体温超过39℃伴四肢抽搐的情况。家长需在发作间隙给药，不可强行灌服避免呛咳。该药含朱砂等成分，连续使用不得超过3天，用药后仍需完善脑电图等检查排除癫痫。
4、流行性脑脊髓膜炎
辅助治疗化脓性脑膜炎出现的剧烈头痛、喷射性呕吐等症状。药物中的黄连、栀子能抑制脑膜炎双球菌等病原体，需与抗生素联合使用。当患者出现颈项强直、皮肤瘀斑等典型表现时，须立即就医进行腰椎穿刺确诊。
5、肝性脑病
对肝硬化失代偿期出现的意识障碍有暂时缓解作用，可通过降低血氨水平改善扑翼样震颤。但需配合乳果糖等降氨药物使用，严重肝功能损害者应减量。用药期间需监测凝血功能，避免与水合氯醛等肝毒性药物同用。
使用清热安宫丸期间应禁食辛辣油腻食物，保持环境安静通风。老年患者用药不超过5天，儿童剂量减半。出现皮疹、心悸等不良反应需停药，过敏体质慎用麝香成分。该药为急救用药，症状缓解后仍需针对原发病进行治疗，不可长期服用。昏迷患者应侧卧防窒息，及时清理口腔分泌物。
