二十五味绿绒蒿丸具有清热解毒、凉血消肿的功效，主要用于治疗流感、咽喉肿痛、扁桃体炎等热性疾病，也可用于缓解感冒引起的发热、头痛等症状。
一、清热解毒
二十五味绿绒蒿丸中的绿绒蒿、藏黄连等成分能有效清除体内热毒，对因热毒积聚引起的口舌生疮、牙龈肿痛有显著改善作用。药理学研究表明，其活性成分可通过抑制炎症因子释放减轻局部充血水肿，适用于急性咽炎早期症状明显者。使用期间需忌食辛辣刺激食物以增强疗效。
二、抗病毒作用
该成药含有的高山紫堇、翼首草等藏药成分对甲型流感病毒具有抑制作用，能缩短病毒性感冒的发热周期。临床多用于流行性感冒初起阶段，症见突发高热、肌肉酸痛时，配合卧床休息可加速康复。但连续使用不宜超过7天，症状无缓解应停用就医。
三、退热镇痛
通过调节体温中枢实现解热效果，对感冒或扁桃体炎导致的38.5℃以下发热有效。其中诃子、毛诃子等成分兼具镇痛作用，可缓解伴随发热出现的头痛、关节痛等不适。儿童使用需减量，家长应监测体温变化，体温超过39℃须及时就医。
四、抗菌消炎
体外实验显示其对金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌等呼吸道常见致病菌有抑制作用，可用于缓解扁桃体化脓性炎症。服药期间若出现扁桃体周围脓肿等严重感染体征，应立即配合抗生素治疗。慢性咽炎患者发作期使用可减轻黏膜充血。
五、免疫调节
方中余甘子、石灰华等药材能增强巨噬细胞吞噬功能，改善反复上呼吸道感染患者的免疫功能。作为辅助治疗药物，对老年体虚感冒后久咳不愈者有一定效果。但自身免疫性疾病患者慎用，避免诱发免疫反应。
服用二十五味绿绒蒿丸期间应保持饮食清淡，多饮温水促进代谢，避免与寒凉性质中药同服。本品为棕褐色水丸，建议饭后温水送服以减少胃肠刺激。治疗呼吸道感染时需配合保持空气流通，症状加重或出现皮疹等过敏反应应立即停药并就诊。贮藏时须置阴凉干燥处，防止药物受潮变性。
