胃疡宁丸具有和胃止痛、制酸止血的功效，主要用于治疗胃溃疡、十二指肠溃疡、慢性胃炎等疾病引起的胃痛、反酸、嗳气、嘈杂、黑便等症状。
胃疡宁丸中的海螵蛸、延胡索等成分能中和胃酸，缓解胃痉挛。该功效适用于因胃酸过多导致的胃部烧灼痛，常见于胃溃疡急性发作期。药物通过抑制胃酸分泌和直接保护胃黏膜，可减轻进食后加重的上腹疼痛。胃溃疡患者服用后通常1-2小时开始起效。
含有的白及、珍珠层粉具有收敛止血作用。对于溃疡面渗血引起的黑便症状，能促进血小板聚集和血管收缩。十二指肠溃疡患者服用后，可观察到柏油样便逐渐转黄。需注意该药仅适用于轻度出血，大量呕血需立即就医。
所含的甘草浸膏能增加胃黏膜血流，促进上皮细胞再生。慢性胃炎患者长期服用可改善胃黏膜糜烂，减少胃镜检查时的出血点。该作用需连续用药2-4周才能明显显现，配合质子泵抑制剂效果更佳。
通过协调胃肠蠕动，缓解胃动力异常导致的早饱感。功能性消化不良患者服用后，嗳气、腹胀症状可减轻。药物中的土木香成分能双向调节胃肠平滑肌，既改善胃瘫也不引起腹泻。
对幽门螺杆菌有一定抑制作用，可作为根除治疗的辅助用药。丸剂中的黄连碱类物质能改变细菌生存环境，与抗生素联用时可提高清除率。但不能单独用于幽门螺杆菌感染根治。
服用胃疡宁丸期间应避免辛辣刺激性食物，戒烟限酒，保持规律饮食习惯。胃痛发作时可用温水送服药丸，不建议嚼碎服用。若用药3天后症状无缓解或出现呕血、剧烈腹痛，须立即停药就医。该药不宜长期连续使用超过8周，孕妇及哺乳期妇女慎用。服药期间定期复查胃镜以评估溃疡愈合情况。
