加味香连丸具有清热燥湿、行气止痛的功效，主要用于治疗湿热内蕴、气滞血瘀引起的胃肠疾病。加味香连丸的功效主要有缓解腹痛、改善腹泻、调节胃肠功能、减轻里急后重感、抑制肠道炎症等。
加味香连丸含黄连、木香等成分，能缓解湿热阻滞导致的腹部胀痛或绞痛。适用于急性胃肠炎、细菌性痢疾等疾病引发的腹痛，常伴随大便黏滞不爽。该药需饭前服用，孕妇及脾胃虚寒者慎用。
方中黄连与白头翁协同可抑制肠道病原微生物，对湿热型腹泻（表现为大便臭秽、肛门灼热）效果显著。临床多用于感染性腹泻的辅助治疗，但不宜与含鞣质的中药同服，避免影响药效。
香附、木香等理气药能促进胃肠蠕动平衡，改善功能性消化不良引起的嗳气、早饱症状。对餐后腹胀明显的肠易激综合征患者有一定调节作用，服用期间需避免生冷油腻饮食。
该成药对痢疾杆菌感染引发的肛门坠胀、便意频繁等症状有缓解效果。其抗炎成分可降低直肠黏膜充血水肿，但严重脓血便患者需联合抗生素治疗，不可单独依赖本药。
黄连素等活性成分可下调肠道促炎因子表达，适用于轻中度溃疡性结肠炎的维持治疗。需注意长期使用可能引发肠道菌群失调，建议配合益生菌制剂，疗程超过2周需监测肝功能。
服用加味香连丸期间应禁食辛辣刺激食物，保持饮食清淡易消化。出现皮疹、头晕等不良反应应立即停药并就医。慢性胃肠疾病患者建议联合饮食调理，每日适量摄入山药、小米等健脾食材，避免过度劳累和精神紧张。不建议自行延长用药周期，症状加重或持续3天未缓解需及时到消化内科就诊。
