电子肛门镜与肠镜是两种不同的消化道检查方式，主要区别在于检查范围、适用疾病和操作方式。
电子肛门镜主要检查肛门和直肠下端病变，适用于痔疮、肛裂、直肠息肉等肛门直肠疾病的诊断。检查时患者取侧卧位，医生将直径约1厘米的硬质镜管插入肛门，可直观观察距肛缘10厘米以内的直肠黏膜。该检查无需肠道准备，操作时间通常5-10分钟，检查过程中可能伴有胀痛感。
肠镜分为乙状结肠镜和全结肠镜两种。乙状结肠镜可检查距肛缘60厘米的肠段，适用于直肠和乙状结肠病变筛查；全结肠镜能观察整个大肠直至回盲部，是结直肠癌筛查的金标准。肠镜检查需要提前1-2天进行饮食调整和服用清肠药物，检查时通过柔软的电子内镜逐步推进，全程约20-30分钟，多数患者需要静脉麻醉。
两种检查的并发症风险不同。肛门镜可能引起肛门撕裂或出血，但发生率低于1%；肠镜存在肠穿孔0.1%-0.3%、出血0.2%等风险，麻醉还可能引发呼吸抑制。对于40岁以上人群的结直肠癌筛查，建议优先选择肠镜；若仅出现便血、肛门疼痛等症状，可先进行肛门镜检查。
