真菌镜检主要用于诊断皮肤癣菌病、念珠菌感染、马拉色菌毛囊炎、孢子丝菌病、曲霉病等真菌性疾病。

真菌镜检可检测表皮角质层中的菌丝或孢子，常见于足癣、手癣、体癣等。皮肤出现环形红斑、脱屑伴瘙痒时，刮取皮屑进行氢氧化钾溶液处理后镜检，阳性结果可见分支分隔菌丝。

适用于口腔鹅口疮、外阴阴道炎等疾病。镜检可见假菌丝和芽生孢子，采集黏膜白膜或分泌物样本，革兰染色后镜检阳性率可达80%。糖尿病患者或长期使用抗生素者易发。

通过镜检发现圆形厚壁孢子确诊。好发于胸背部的红色丘疹，取毛囊内容物经派克墨水染色后，可见成簇的"汉堡包样"孢子。多发于油性皮肤或免疫力低下人群。

皮肤淋巴管型需穿刺脓液镜检，可见雪茄样孢子。多发于园艺工作者，表现为沿淋巴管排列的溃疡结节。需与结核性淋巴结炎鉴别，培养法可提高检出率。

肺部感染时取痰液镜检可见45度分枝的有隔菌丝。侵袭性曲霉病需结合CT检查，常见于血液病化疗患者。支气管肺泡灌洗液镜检敏感性高于痰检。

检查前24小时避免使用抗真菌药物，皮损部位勿涂抹护肤品。采样时选择活动性皮损边缘，指甲病变需深层刮取。镜检阴性不能完全排除感染，建议结合真菌培养。日常保持患处干燥，穿透气衣物，糖尿病患者需严格控制血糖。出现持续红斑、化脓等症状应及时复检。