清瘟解毒丸主要用于治疗风热感冒、流行性感冒等病毒性上呼吸道感染疾病，具有清热解毒、疏风散邪的功效。
1、风热感冒
风热感冒多表现为发热重、咽喉肿痛、咳嗽痰黄等症状，清瘟解毒丸中的连翘、板蓝根等成分能清热解毒，缓解上述症状。患者服用时须注意避免辛辣刺激性食物，体温持续超过38.5℃或症状加重时应及时就医。
2、流行性感冒
流行性感冒由流感病毒引起，常见突发高热、全身酸痛、头痛乏力，清瘟解毒丸通过大青叶、柴胡等成分发挥抗病毒作用。对于免疫功能低下或合并细菌感染者，需在医生指导下联合其他药物治疗。
3、急性扁桃体炎
该药对风热袭肺型急性扁桃体炎引起的咽部灼热、吞咽困难有缓解效果，其含有的黄芩、玄参能减轻黏膜水肿。若出现化脓性分泌物或反复发作，建议配合抗生素治疗。
4、腮腺炎
轻症流行性腮腺炎患者使用清瘟解毒丸可改善腮腺肿胀疼痛，但合并睾丸炎或胰腺炎等并发症时需及时转西医治疗。用药期间应保持口腔清洁，避免酸性食物刺激唾液分泌。
5、手足口病
对于手足口病轻型患者的口腔疱疹、低热症状，该药有一定辅助疗效。但出现持续高热、肢体抖动等神经系统症状属重症表现，须立即住院治疗，不能单纯依赖中成药。
使用清瘟解毒丸期间应保持充足休息，每日饮水量不少于1500毫升，饮食以清淡易消化的粥类、果蔬为主。服药3天后若无改善或出现皮疹、腹泻等不良反应需停药就诊。高血压、心脏病患者及孕妇应在医师指导下谨慎使用，不可与滋补性中药同服。储存时注意防潮避光，开封后超过1个月不宜继续服用。
