紧急避孕药危害通常不大，但可能引起一些暂时性的身体不适。紧急避孕药主要通过高剂量激素干扰排卵或受精过程来达到避孕目的，其常见的不良反应多为短期且可逆的。
大多数情况下，服用紧急避孕药后可能出现恶心、呕吐、头痛、头晕、乏力、乳房胀痛等类似早孕反应的不适，这些症状通常在服药后24小时内出现，持续不超过2天，一般无须特殊处理，可自行缓解。服药后还可能导致月经周期改变，表现为月经提前或推迟，月经量也可能增多或减少，这种影响通常只持续一个周期，后续月经会恢复正常。部分女性在服药后几天可能出现少量阴道点滴出血，这属于撤退性出血，是药物作用的正常表现，一般量少、时间短，不会对健康造成长期影响。极少数情况下，如果服药后2小时内发生呕吐，药物可能未被完全吸收，避孕效果会受到影响，需要及时补服。需要强调的是，紧急避孕药仅对单次无保护性生活有效，不能作为常规避孕手段反复使用，频繁使用会增加月经紊乱的发生概率，并可能影响卵巢的正常排卵功能。
建议在服用紧急避孕药后注意观察身体反应，若出现剧烈腹痛、严重头痛、视力模糊或月经推迟超过一周等情况，应及时就医检查。日常应选择更可靠的常规避孕方式，如短效口服避孕药、避孕套或宫内节育器，以减少对身体的潜在影响。
