治疗胃窦发炎的药物有奥美拉唑、雷贝拉唑、埃索美拉唑、泮托拉唑、雷尼替丁、甘羟铝、铝镁加混悬液、莫沙必利、吲哚美辛、阿司匹林等，不同情况其用药方案不同，建议在医生的指导下用药。
1.由于胃酸过强导致胃窦发炎可以选择使用抑制胃酸的药物，主要有奥美拉唑，雷贝拉唑，埃索美拉唑，泮托拉唑、雷尼替丁等药物；
功能主治：用于缓解胃酸过多引起的胃痛、腹部不适、胃灼热感(烧心)反酸、腹胀、恶心、呕吐、嗳气等症状。
用法用量：本品应在餐间或睡前口服，成人每次10ml(1袋)，每日3次。
2.还可以使用黏膜保护剂，如甘羟铝、铝镁加混悬液；
3.如果患者胃动力不好，有消化不良饱胀的感觉，可以服用增强胃动力的药物，例如健胃消食片、莫沙必利等等。
同时，胃窦发炎应该检查是否存在幽门螺旋杆菌感染，排除有没有口服刺激胃黏膜的药物，如非甾体类抗炎药，像吲哚美辛、阿司匹林这一类。如果合并幽门螺旋杆菌需要使用四联疗法，比如泮托拉唑，枸橼酸铋钾，克拉霉素，替硝唑根治幽门螺杆菌。
治疗胃窦炎应遵循个体化原则，针对病因。同时还应缓解症状，改善胃粘膜炎症。同时患者要注意调整自己的饮食规律，戒除不良的饮食习惯。饮食的选择方面一定要忌食生冷，过热，干硬，粗糙，油腻等不易于消化的食物，忌吃一些有刺激性的食物。
