慢性溃疡性结肠炎首选氨基水杨酸类药物；因感染导致慢性结肠炎时，可用抗生素治疗；病情严重时可用糖皮质激素、免疫调节剂治疗。
1、氨基水杨酸类药物
治疗慢性溃疡性结肠炎常用药物，对症用药可有效缓解病情。
2、抗生素
慢性结肠炎发生与感染因素有很大关系。如果出现发烧、腹泻、腹痛等症状，或克罗恩病引起的慢性结肠炎，可在医生指导下应用抗生素治疗。
3、糖皮质激素
病情较严重时可选择短期小剂量应用糖皮质激素类药物治疗，病情缓解后应逐渐减少药量，慢慢停药。
4、免疫调节剂
慢性结肠炎病情严重时应用糖皮质激素类药物治疗无效，或应用激素类药物治疗，病情缓解需维持治疗时，可应用免疫调节剂。
5、益生菌
慢性结肠炎肠道菌群失衡，伴随腹痛、腹泻等症状，此时可服用益生菌调理肠道菌群，缓解腹泻症状。
