研究表明，奥密克戎变异株同时存在三个重要氨基酸突变位点，可能会降低疫苗和抗体药物的保护效力，但仍需进一步研究。
经研究发现，新冠病毒S蛋白若出现K417N、E484A或N501Y突变，提示免疫逃逸能力增强；而奥密克戎变异株同时存在“K417N+E484A+N501Y”三重突变，因此该毒株有潜在增加免疫逃逸的能力，但这些突变位点叠加一起是否进一步导致免疫逃逸，现在还不清楚。此外，奥密克戎变异株还存在其他多个可能降低部分单克隆抗体中和活性的突变。突变的叠加可能降低部分抗体药物对奥密克戎变异株的保护效力，对现有疫苗免疫逃逸的能力，有待进一步监测研究。
