六君子丸的注意事项主要有避免辛辣油腻食物、孕妇慎用、过敏体质者慎用、感冒发热患者不宜使用、服药期间出现不适及时就医等。建议遵医嘱使用该药物，并注意饮食清淡和生活规律。
服用六君子丸期间需避免食用辛辣刺激性食物及油腻厚味。此类食物可能影响脾胃运化功能，与药物功效相拮抗。建议选择易消化的粥类、蒸煮蔬菜等清淡饮食，有助于药物吸收发挥补脾益气作用。
六君子丸含有人参等补益成分，孕妇使用可能影响胎儿发育。妊娠期女性如确需使用，必须由中医师评估体质后开具处方。哺乳期妇女同样应在医师指导下谨慎使用。
对党参、白术、茯苓等中药成分过敏者可能出现皮疹、瘙痒等不良反应。首次服用应观察有无过敏反应，过敏体质者建议提前进行药物过敏测试，出现过敏症状需立即停药并就医。
外感发热期间服用补益类中药可能闭门留寇，加重发热症状。感冒患者应待表证解除后再考虑使用。若出现咽喉肿痛、鼻塞流涕等外感症状时，应暂停服药并及时咨询医师。
服药后如出现腹胀、腹泻等胃肠不适，或头晕、心悸等异常反应，可能属于个体不耐受现象。应立即停药并保留剩余药品及包装，携带至医疗机构由医生判断是否需要调整用药方案。
服用六君子丸期间应保持规律作息，避免过度劳累。可配合适量八段锦、太极拳等舒缓运动增强体质。饮食上可搭配山药、莲子等健脾食材，忌食生冷瓜果。建议定期复诊评估疗效，连续服用超过两周需重新辨证。保存药品时注意防潮避光，置于儿童无法接触处。
