凌晨三点醒来的现象可能由生理性节律紊乱、睡眠呼吸暂停综合征、焦虑抑郁等心理因素、胃食管反流或更年期激素变化引起。常见诱因包括昼夜节律失调导致的早醒型失眠，或与褪黑素分泌异常相关。
生理性因素中，年龄增长导致的睡眠片段化是常见原因，60岁以上人群深度睡眠减少，夜间易醒。昼夜节律紊乱者生物钟提前，表现为早睡早醒。睡前摄入咖啡因或酒精会干扰睡眠周期，使人在凌晨清醒。
病理性因素需重点关注睡眠呼吸暂停综合征，患者因呼吸暂停导致的缺氧而频繁觉醒，多伴有白天嗜睡、鼾声中断。抑郁症患者常见早醒症状，多伴随情绪低落、兴趣减退。胃食管反流患者在平卧时胃酸刺激食管，易在凌晨3-4点因烧灼感惊醒。
改善措施应从睡眠卫生入手，保持卧室温度18-22℃、湿度50%-60%，使用遮光窗帘阻断凌晨光线。针对胃食管反流者可抬高床头15厘米，晚餐避免高脂饮食。认知行为疗法对心理因素导致的早醒有效，通过睡眠限制重建睡眠节律。
持续早醒超过两周并影响日间功能时，建议到睡眠医学中心进行多导睡眠监测。需警惕甲状腺功能亢进、不宁腿综合征等潜在疾病，及时完善甲状腺功能检查、血清铁蛋白检测等鉴别诊断。
