紧急避孕药通常不会导致不孕不育，但长期或频繁使用可能影响月经周期和卵巢功能。紧急避孕药主要通过抑制排卵、干扰受精或阻止受精卵着床发挥作用，正确使用不会对生育能力产生永久性损害。
紧急避孕药的主要成分通常是大剂量孕激素，如左炔诺孕酮，偶尔使用不会对卵巢功能造成不可逆影响。部分女性服药后可能出现月经周期紊乱，表现为月经提前或推迟，这种变化多为暂时性，一般1-2个月经周期后可自行调节。少数人会有恶心、乳房胀痛等轻微副作用，通常24小时内缓解。正确使用紧急避孕药避孕成功率较高，但需注意其并非常规避孕方式，不能替代短效避孕药或避孕套等长期避孕措施。
长期频繁使用紧急避孕药可能干扰下丘脑-垂体-卵巢轴，导致内分泌紊乱，表现为月经不规律、经量改变甚至闭经。一年内使用超过3次可能增加卵巢功能异常风险，但这种情况较为少见。存在多囊卵巢综合征等基础疾病的女性更需谨慎使用。紧急避孕药对输卵管功能和子宫内膜容受性的影响通常是可逆的，停药后多数女性生育能力可恢复正常。
建议将紧急避孕药作为无保护性行为后的补救措施，每年使用不超过2次。若服药后出现持续月经紊乱或备孕半年未成功受孕，应及时就诊妇科检查激素水平和卵巢功能。日常应优先选择短效避孕药、避孕套等常规避孕方法，减少紧急避孕药使用频率。保持规律作息和均衡饮食有助于维持生殖系统健康。
