六味木香胶囊具有行气止痛、和胃消食的功效，主要用于治疗胃肠气滞证，可缓解胃脘胀痛、嗳气食少、胁肋胀闷等症状。
1、行气止痛
六味木香胶囊中的木香、豆蔻等成分能疏通气机，缓解胃脘及胁肋胀痛。适用于因情志不畅或饮食不节导致的胃肠功能紊乱，常伴有反酸、恶心等症状。
2、和胃消食
本品所含山楂、荜茇等药材可促进胃液分泌，减轻食积腹胀。针对暴饮暴食后出现的嗳气腐臭、食欲不振等情况，服药期间需配合清淡饮食。
3、调节胃肠蠕动
方中土木香能双向调节胃肠平滑肌，改善功能性消化不良引起的排便异常。可能出现排便次数增多等反应，一般停药后可自行恢复。
4、抗菌消炎
部分成分对幽门螺杆菌有一定抑制作用，可辅助治疗慢性浅表性胃炎。但不可替代正规抗感染治疗，合并感染者仍需联合抗生素。
5、疏肝解郁
药物配伍具有轻度疏肝作用，可改善焦虑或抑郁状态伴随的消化症状。长期情绪障碍者建议配合心理疏导。
服用六味木香胶囊期间应忌食辛辣刺激食物，避免加重胃肠负担。出现皮疹、心悸等过敏反应需立即停药。慢性病患者及孕妇用药前应咨询医生，不建议自行长期连续使用超过2周。症状无改善或加重时须及时就医明确病因。
