保温杯可以短期存放煎好的中药，但不建议长期存放。中药含有多种有机成分，长时间高温接触金属内胆可能影响药效或产生化学反应。
煎好的中药在60-80摄氏度的保温杯中存放4-6小时较为安全，超过该时长可能导致药液酸败或有效成分降解。常见解表类中药如麻黄汤、桂枝汤等含挥发性成分，高温密闭保存会加速有效物质挥发。含鞣质的中药如五倍子、地榆等，与金属长时间接触可能生成沉淀物。部分矿物类中药如石膏、代赭石在酸性环境下可能析出金属离子。部分患者使用保温杯存放中药后出现腹泻或药效减弱，可能与上述因素有关。
特殊剂型的中药需特别注意，颗粒剂冲泡后应在2小时内饮用完毕，避免糖分发酵变质。代煎的袋装中药液在未开封状态下可冷藏保存，但倒入保温杯后也应尽快服用。含动物蛋白的虫类中药如全蝎、蜈蚣煎剂，蛋白质在40摄氏度以上环境超过3小时易滋生细菌。部分患者误将保温杯当作长期储存容器，连续数日存放同剂中药，这种做法会显著增加药物变质风险。
建议使用玻璃或陶瓷器皿盛放中药，若必须用保温杯，选择316医用级不锈钢内胆产品。服用前观察药液是否出现絮状物、异味或颜色异常，煎好的中药最好在当天分次饮用完毕。存放期间避免剧烈摇晃保温杯，不同种类中药不宜混合存放。特殊体质患者或贵重药材煎剂，应严格遵循医师指导的保存方法。
