藿香正气水不能作为退烧的主要治疗方法。发烧通常由感染、炎症等因素引起，藿香正气水主要用于缓解胃肠型感冒引起的恶心呕吐等症状，其解表化湿功效对部分低热可能有一定辅助作用，但无法替代退烧药物。
藿香正气水含有苍术、陈皮等成分，可通过调节胃肠功能间接改善因暑湿引起的轻微体温升高。对于38.5摄氏度以下的低热，若伴随头晕胸闷、脘腹胀痛等暑湿症状，在医生指导下可配合物理降温使用。但需注意该药含酒精成分，儿童、酒精过敏者及服用头孢类药物者禁用。
当体温超过38.5摄氏度或持续高热时，应及时使用对乙酰氨基酚、布洛芬等专用退烧药。细菌感染引起的发热需配合抗生素治疗，病毒感染则需对症处理。藿香正气水对这类病理性高热无明显效果，盲目使用可能延误病情。
出现发热症状时应先明确病因，监测体温变化。建议保持室内通风，适量补充水分，采用温水擦浴等物理降温方式。若发热伴随意识模糊、抽搐、皮疹等严重症状，或婴幼儿持续高热，须立即就医。用药需严格遵循医嘱，不可自行替代或混用药物。
