明目上清丸主要有清热散风、明目止痛的功效，适用于外感风热所致的眼目红肿热痛、畏光流泪等症状。
功能主治：伴随下述疾患的角结膜上皮损伤：1.干燥综合征(Sjogren's syndrome)、斯-约二氏综合征(Stevens-John sonsyndrome)、干眼综合征(dry eye syndrome)等内因性疾患；2.手术后、药物性、外伤、配戴隐形眼镜等外因性疾患。
用法用量：一般一次1滴，1天滴眼5～6次，可根据症状适当增减。一般使用0.1%浓度的玻璃酸钠滴眼液，重症疾患以及效果不明显时使用0.3%的玻璃酸钠滴眼液。
明目上清丸中的菊花、黄芩等成分可疏散风热，缓解因外感风热引起的眼部充血、发痒。常见于急性结膜炎早期，患者可能伴有轻微头痛或鼻塞，此时配合冷敷可加强效果。风热型结膜炎发作时，还可遵医嘱联用盐酸左氧氟沙星滴眼液、利巴韦林滴眼液等抗感染药物。
方中蝉蜕、决明子等药材能清肝明目，改善视物模糊或眼前黑影飘动等症状。对于早期玻璃体混浊或轻度角膜云翳，用药后可能减轻视觉干扰。若伴随眼压升高或视野缺损，需排查青光眼并与硝酸毛果芸香碱滴眼液等降眼压药物联用。
薄荷脑、白芷等成分具有局部镇痛作用，可缓解麦粒肿、睑腺炎导致的眼睑胀痛。红肿明显时可联合妥布霉素地塞米松眼膏控制炎症。化脓性病变需配合切开引流等处理。
对光敏感伴随眼睑痉挛的症状，药物中防风等成分能减轻刺激反应。适用于虹膜睫状体炎恢复期或轻度电光性眼炎，严重光敏感需排查葡萄膜炎并配合双氯芬酸钠滴眼液治疗。
对于长时间用眼导致的干涩酸胀，药物滋养作用可辅助改善睫状肌调节功能，但需与玻璃酸钠滴眼液等人工泪液区分使用。器质性眼病如屈光不正仍需验光配镜。
使用明目上清丸期间应避免辛辣刺激饮食，高血压患者需监测血压变化。眼外伤、青光眼急性发作等急重症须立即就医，服药3天后症状无改善或出现眼痛加重、视力骤降时，应及时停用并就诊眼科。日常注意用眼卫生，连续用眼40分钟后建议远眺放松。
