阴茎短小一般不建议单纯依靠药物治疗，因为多数情况下，阴茎短小是先天发育或遗传因素导致的，药物难以改变其解剖结构。如果短小是由特定疾病如激素水平异常引起的，在医生指导下使用药物可能有一定帮助。建议先就医明确原因，切勿自行用药。
对于大多数因遗传或正常个体差异导致的阴茎短小，药物治疗效果有限，因为这类情况属于正常的生理变异，并非疾病。阴茎的发育在青春期基本完成，成年后使用任何药物都无法让海绵体组织再生或延长。如果盲目使用激素类药物，反而可能干扰体内正常的内分泌平衡，带来副作用。对于确实存在激素水平异常的情况，如由下丘脑-垂体-性腺轴功能障碍导致的性腺功能减退症，在医生明确诊断后，可能会使用人绒毛膜促性腺激素或十一酸睾酮等药物。这些药物通过补充或刺激体内雄激素的分泌，能促进第二性征发育，对部分因激素缺乏导致的阴茎发育不良有改善作用。但这类治疗有严格的适应证和窗口期，通常针对青春期前的儿童或青少年，且必须在专业医生的全面评估和监测下进行，绝不可自行购买使用。对于成年后因外伤、手术或糖尿病等疾病导致的继发性阴茎萎缩或勃起功能障碍，药物治疗的目标是改善勃起硬度和功能，而非延长阴茎长度，常用药物如西地那非片、他达拉非片等，它们通过扩张血管增加阴茎血流量来改善勃起状态，但同样无法改变阴茎的静态尺寸。
无论何种情况，都应将就医放在首位，由医生通过体格检查、激素水平检测等手段明确诊断。日常中应避免轻信网络或非正规渠道宣传的“增粗增长”药物或保健品，这些产品成分不明，可能含有违禁激素或重金属，长期使用会损伤肝肾功能。保持健康的生活方式，如均衡饮食、规律作息、适度运动，有助于维持良好的内分泌状态和性功能。如果阴茎短小对心理造成了较大困扰，可以寻求心理医生的帮助，建立正确的身体认知，避免过度焦虑。
