小建中颗粒不宜与部分药物合用，主要存在配伍禁忌的药物包括含鞣质的中药制剂、强心苷类药物以及部分抗生素。合用可能导致药效降低或不良反应增加，具体需在医师指导下调整用药方案。
含鞣质的中药如五倍子、地榆等与小建中颗粒同服时，可能产生沉淀物影响吸收。强心苷类药物如地高辛与该颗粒联用可能加重心脏毒性反应，因其中甘草成分易引发低钾血症。部分抗生素如四环素类、喹诺酮类与小建中颗粒中的金属离子结合会形成螯合物，降低抗菌效果。
特殊情况下需注意解表类药物如麻黄汤的合用可能影响发汗解表效果。缓泻剂与该颗粒联用可能减弱其温中补虚作用。孕妇及糖尿病患者联合用药时更需谨慎评估风险。
建议用药前向中医师或药师详细说明正在使用的所有药物，包括处方药、非处方药及保健品。出现心悸、恶心等异常反应时应立即停药就医。中药联合使用需间隔2小时以上，西药联合使用需参照药物代谢周期调整给药时间。
