小儿化毒散主要用于清热解毒、凉血消肿，适用于小儿热毒内蕴引起的口疮、喉痹、乳蛾、疖肿等症状。
小儿化毒散含牛黄、珍珠等成分，可清除体内热毒，缓解发热烦躁、咽喉肿痛等热症。适用于风热感冒初期或疱疹性咽峡炎伴发口腔溃疡时，需注意脾胃虚寒患儿慎用。
方中赤芍、冰片具有活血凉血功效，能改善局部充血肿胀。常用于急性扁桃体炎引起的咽喉充血，或皮肤疖肿早期红肿热痛阶段，外用时可配合生理盐水湿敷增强效果。
对小儿鹅口疮、疱疹性口腔炎等口腔黏膜溃疡有促进愈合作用。含漱或局部涂抹可形成保护膜，减轻进食疼痛，但重度溃疡需配合维生素B2片剂等联合治疗。
针对急性喉炎导致的声嘶、犬吠样咳嗽，可短期辅助缓解喉头水肿。重症出现呼吸困难时须立即就医，不可单独依赖本品，需配合布地奈德雾化吸入等西医治疗。
对早期未化脓的毛囊炎、疖子有消肿止痛效果。外用时应保持患处清洁，化脓破溃后禁用。反复发作的皮肤感染需排查免疫功能问题，必要时联合头孢克洛干混悬剂抗感染。
使用小儿化毒散期间应保持饮食清淡，避免辛辣刺激食物。外用时注意观察皮肤反应，出现过敏立即停用。本品不宜长期连续使用超过7天，症状无改善或加重时应及时就医评估。服药后可能出现大便次数增多属正常现象，但出现水样便需停药。存储时需避光防潮，开封后建议1个月内用完。
