药物流产的过程通常包括术前评估、服药与观察、以及术后复查三个阶段，主要步骤有术前检查确认适应症、遵医嘱服用米非司酮片与米索前列醇片、留院观察妊娠组织排出情况、以及术后复查确认流产完全。
药物流产的第一步是进行全面的术前评估。孕妇需要到医院妇科就诊，医生会详细询问病史、末次月经时间，并进行妇科检查、血常规、凝血功能、血型、心电图、B超等检查。B超检查至关重要，用于确认是否为宫内妊娠，并准确测量孕囊大小、位置，评估孕周。药物流产通常适用于停经49天内的宫内妊娠，且孕妇身体健康，无使用米非司酮片和米索前列醇片的禁忌症，如肾上腺疾病、血液病、心血管疾病、青光眼、哮喘、过敏体质等。医生在确认符合药物流产条件后，会向孕妇及家属详细说明流产过程、可能出现的风险、服药后注意事项，并签署知情同意书。
第二阶段是遵医嘱服药与严密观察。药物流产通常采用米非司酮片与米索前列醇片序贯给药方案。首先，孕妇需遵医嘱在家服用米非司酮片，该药物具有抗孕激素作用，能使胚胎停止发育并与子宫壁剥离。服药期间可能出现恶心、呕吐、乏力等不适，一般无须特殊处理，但需注意阴道出血情况。服用米非司酮片后，孕妇需按照预约时间返回医院，在医生监护下服用米索前列醇片。此药物可引起子宫强烈收缩，促使胚胎组织排出体外。服药后需在医院观察4至6小时，密切注意腹痛、阴道出血情况及是否有妊娠组织排出。医护人员会检查排出的组织物是否完整，并评估出血量。多数孕妇在服用米索前列醇片后数小时内会排出孕囊，表现为腹痛加剧后缓解，伴有较多阴道出血和白色肉样组织排出。
最后阶段是术后恢复与随访复查。孕囊排出后，阴道出血会逐渐减少，但可能持续1至2周，量少于或等于月经量。医生会开具促进子宫收缩和预防感染的药物，如益母草颗粒、新生化颗粒或头孢克肟胶囊等，须严格遵医嘱服用。术后需休息2周，避免重体力劳动和剧烈运动，注意会阴部清洁，1个月内禁止性生活、盆浴和游泳，以预防感染。术后饮食应加强营养，多摄入富含优质蛋白和铁的食物，如鱼肉、瘦肉、动物肝脏和新鲜蔬菜水果，帮助身体恢复。最关键的一步是术后复查，通常建议在流产后2周左右返回医院进行B超检查，以确认宫腔内妊娠组织是否已完全排出。如果复查发现流产不全，即宫腔内仍有残留组织，可能需要进行清宫手术。术后还需采取有效的避孕措施，待正常月经恢复后再计划下次妊娠。
药物流产后身体处于恢复期，充分的休息和合理的营养支持至关重要。应保证每日睡眠充足，避免熬夜和过度劳累。饮食上宜清淡易消化，逐步增加营养，可适量食用小米粥、鸡蛋羹、清蒸鱼等，避免生冷、辛辣、油腻食物。保持个人卫生，每日用温水清洗外阴，勤换内裤和卫生巾。观察阴道出血量和腹痛情况，如果出血量超过平时月经量最多的一天，或出血时间超过两周，或出现发热、剧烈腹痛、分泌物有异味等情况，应立即返院就诊。情绪上可能因激素水平变化和流产经历而产生波动，可与家人朋友沟通，寻求情感支持。流产后卵巢功能一般很快恢复，务必在医生指导下尽早落实可靠的避孕措施，为下次健康妊娠做好准备。
