扁桃体肿大在急性感染期通常吃药好，在反复发炎或引起呼吸阻塞时通常做手术好。
扁桃体肿大吃药治疗的优点在于操作便捷、无创伤且能迅速控制急性炎症，适用于由细菌或病毒感染引起的初期肿胀，通过药物干预可有效缓解咽痛和发热症状，避免病情进一步恶化。手术治疗的优点则在于能够彻底切除病灶，从根本上解决因扁桃体过度肥大导致的睡眠呼吸暂停、吞咽困难以及每年多次反复发作的化脓性扁桃体炎问题，显著降低未来感染概率并改善生活质量。两种方式各有侧重，吃药侧重于保守治疗与症状缓解，手术侧重于根治疾病与功能恢复，患者需根据自身病程长短及发作频率进行权衡。
吃药治疗的缺点主要是对于已经形成慢性纤维化增生或存在解剖结构异常的巨大扁桃体效果有限，且长期依赖抗生素可能导致菌群失调或产生耐药性，无法阻止扁桃体的物理性增大。手术治疗的缺点包括需要承担麻醉风险、术后会出现明显的咽喉疼痛及短暂的进食困难，恢复周期相对较长，且存在极少数术后出血或感染的并发症风险，对患者的身体耐受度有一定要求。此外，手术作为一种有创操作，一旦切除便不可逆转，可能会让部分人群担心局部免疫屏障的暂时性减弱，尽管目前医学观点认为其整体免疫功能影响较小。
日常生活中应注意保持口腔卫生，早晚刷牙并使用温盐水漱口以减少细菌滋生，饮食上要多吃清淡易消化的流质或半流质食物，避免辛辣刺激性食品加重咽喉充血，同时保证充足睡眠以增强机体免疫力，若出现高热不退或呼吸不畅等严重症状应及时前往医院耳鼻喉科就诊评估。
