怀孕三个月肚子疼可能由子宫增大、韧带牵拉、胃肠功能紊乱、先兆流产或泌尿系统感染引起，需结合具体症状判断。

1、子宫增大：

妊娠12周子宫逐渐超出盆腔，圆韧带受到机械性牵拉可能引发下腹隐痛。这种疼痛多为间歇性钝痛，改变体位或休息后可缓解，属于正常生理现象。建议避免突然起身或剧烈活动，采用侧卧位减轻韧带张力。

2、韧带牵拉：

随着子宫体积增大，子宫圆韧带被拉伸可能引起双侧腹股沟区牵扯痛，尤其在咳嗽、打喷嚏时加重。疼痛特点为尖锐刺痛但持续时间短，可通过热敷或孕妇瑜伽缓解。若疼痛持续超过2小时或伴随出血需就医。

3、胃肠功能紊乱：

孕激素水平升高会减缓肠道蠕动，可能引发胀气、痉挛性腹痛，多位于脐周且伴有便秘。建议少量多餐，增加膳食纤维摄入，适量饮用温水缓解症状。避免食用豆类、洋葱等产气食物。

4、先兆流产：

病理性腹痛多表现为下腹正中持续性坠痛或阵发性绞痛，可能伴随阴道出血或腰骶部酸胀。这种情况需立即就医评估，超声检查可确认胚胎状况，必要时需使用黄体酮等药物进行保胎治疗。

5、泌尿系统感染：

妊娠期免疫力下降易发生尿路感染，表现为下腹隐痛伴尿频尿急，严重时可出现发热。需通过尿常规确诊，选择头孢类等孕期安全抗生素治疗。每日饮水2000ml以上有助于冲刷尿道。

孕期腹痛需密切观察症状变化，记录疼痛部位、持续时间和伴随症状。建议每日进行30分钟温和运动如散步，避免仰卧起坐等腹部用力动作。饮食上增加优质蛋白和维生素E摄入，如鸡蛋、坚果等有助于维持妊娠。出现规律宫缩、持续出血或发热超过38℃时，应立即前往产科急诊。保持外阴清洁干燥，排便后从前向后擦拭，预防泌尿生殖系统感染。建议每4周进行一次产前检查，通过胎心监测和超声及时掌握胎儿发育情况。