保赤丸的主治是：健脾、祛滞、祛痰，主要功效是：小儿大便秘结、乳滞疳积、喘咳痰鸣、吐泻发热、痰厥惊风、乳食减少、四时感冒、发育不良、脾胃虚弱等症；也可以用于成人痰湿阻滞证、肠胃不清。
现代研究表明保赤丸具有的作用是，能够让松弛紧张状态的胃肠道平滑肌，同时又能够提高松弛的胃肠道平滑肌的紧张度，具有双向调节作用；还能够激活消化酶当中的胃蛋白酶活性，可以加速胃肠道的蠕动，促进排空胃肠道内容物的速度，加快胃肠道的排空速度。保赤丸副作用目前暂时不明确，因此小孩需要在医生的指导下用药，不可以擅自服药、停药和改变用药剂量。
