克氏综合征是指先天性曲细精管发育不全综合征，是一种男性精子染色体不分离的疾病，容易出现不孕。怀孕是指妊娠。一般情况下，先天性曲细精管发育不全综合征竟然妊娠了可能是未及时诊断、含有少量精液、异位妊娠等原因引起的，可以通过日常护理、手术治疗的方式缓解病情。具体分析如下：

1.未及时诊断：曲细精管发育不全综合征可能不易被察觉，若不及时发现并治疗，疾病会对男性生育能力造成威胁。如果没有及时诊断，病情好转，也会出现妊娠。

2.含有少量精液：尽管患者每次进行性生活的时候精子数量较少，但仍有可能造成妊娠。

3.异位妊娠：由于子宫外膜上皮能够接受精子并形成受精卵，因此也可能出现女性的妊娠。患者需要及时在医生指导下进行检查，然后进行清宫术。

除以上相对常见原因以外，还可能是其他因素导致的，如发育不充分的曲细精管仍能通过性交来传输精子、其他疾病影响、药物刺激。如果有严重不适情况，建议及时就医。