卵巢囊肿的治疗方式需根据囊肿性质、大小及症状决定，多数生理性囊肿可通过药物控制，病理性或较大囊肿可能需手术干预。
药物治疗适用于体积较小且无恶性征象的卵巢囊肿，尤其是功能性囊肿或子宫内膜异位囊肿。常用药物包括桂枝茯苓胶囊、散结镇痛胶囊等中成药调节内分泌，或屈螺酮炔雌醇片等短效避孕药抑制囊肿生长。这类治疗需配合超声定期复查，观察囊肿变化。若伴随痛经或异常出血，可联用布洛芬缓释胶囊缓解症状。药物治疗周期通常持续3-6个月，期间需监测肝肾功能。
手术治疗针对直径超过5厘米的囊肿、存在实性成分的肿瘤，或出现扭转、感染等急症时实施。腹腔镜卵巢囊肿剥除术适用于大多数良性病变，具有创伤小、恢复快的优势。对于绝经后女性或疑似恶性肿瘤的囊肿，可能需行患侧附件切除术。术后需病理检查明确性质，恶性病变需进一步放化疗。手术可能影响卵巢储备功能，年轻患者需谨慎评估。
日常应避免剧烈运动以防囊肿破裂，规律作息有助于内分泌平衡。建议每3-6个月复查妇科超声，突发剧烈腹痛需立即就医。治疗期间保持低脂高纤维饮食，限制豆制品等植物雌激素摄入。根据年龄、生育需求及囊肿特征制定个体化方案，药物与手术并非对立选择，部分病例需序贯治疗。
