紧急避孕药的有效成分通常在服用后24-48小时内代谢完毕，但完全排出体外可能需要3-5天。药效持续时间与药物类型、个体代谢差异等因素有关。
左炔诺孕酮类紧急避孕药主要通过抑制排卵、干扰受精卵着床发挥作用，服药后72小时内有效。药物在肝脏代谢后经肾脏排出，代谢速度受体重、肝功能影响，体重超过70公斤者药效可能降低。米非司酮类紧急避孕药代谢较慢，完全清除需5-7天，服药后120小时内有效。紧急避孕药代谢期间可能出现恶心、乳房胀痛等副作用，通常1-2天自行缓解。重复使用可能扰乱月经周期，一年内使用不建议超过3次。
服用后需观察下次月经情况，若延迟超过1周应检测是否怀孕。紧急避孕药无法替代常规避孕措施，长期避孕建议使用避孕套、短效避孕药等方法。服药后出现严重腹痛或异常出血应及时就医。
