深部真菌感染的首选药物主要有氟康唑、两性霉素B和伏立康唑。这些药物的选择需根据感染类型、患者免疫状态及药物敏感性决定。
氟康唑适用于念珠菌属和隐球菌感染，尤其对白色念珠菌效果显著。该药物通过抑制真菌细胞膜麦角固醇合成发挥作用，生物利用度高且能穿透血脑屏障。肝功能异常者需调整剂量。
两性霉素B是治疗侵袭性曲霉病和组织胞浆菌病的经典药物，通过与真菌细胞膜固醇结合产生杀菌作用。脂质体制剂可降低传统剂型的肾毒性，但用药期间仍需监测肾功能与电解质水平。
伏立康唑对曲霉属和镰刀菌属具有强效抗菌活性，其广谱特性使其成为血液系统恶性肿瘤患者真菌感染的一线选择。该药存在光敏性不良反应，用药期间需避免紫外线暴露。
特殊情况下可考虑卡泊芬净等棘白菌素类药物，这类药物通过抑制β-1，3-D-葡聚糖合成酶干扰真菌细胞壁形成。对于耐药菌株感染，建议进行体外药敏试验指导用药。所有抗真菌治疗均需在医生监督下进行，疗程通常持续至临床症状消失后两周。
