含牙囊肿手术多数情况下不会留下明显的后遗症，但术后恢复和个体差异可能导致一些短期不适或并发症。

含牙囊肿是一种常见的口腔颌面部疾病，通常需要通过手术切除囊肿及受累牙齿。手术本身属于常规操作，技术成熟，术后恢复良好。术后短期内可能会出现局部肿胀、疼痛或轻微出血，这些症状通常会在几天至一周内逐渐缓解。术后需遵医嘱服用抗生素预防感染，并注意口腔卫生，避免食用过硬或刺激性食物。

少数情况下，手术可能导致一些并发症。术后感染是较为常见的风险，表现为局部红肿、疼痛加重或发热，需及时就医处理。手术过程中若损伤邻近神经，可能导致局部麻木或感觉异常，这种情况多数在数月内自行恢复，但也有少数患者可能遗留长期不适。手术可能影响牙齿排列或咬合功能，需根据具体情况考虑后续正畸治疗。

术后护理是减少后遗症的关键。建议术后定期复查，观察伤口愈合情况，及时发现并处理异常。保持口腔清洁，使用温盐水漱口有助于预防感染。饮食上以软食为主，避免过热或过冷食物刺激伤口。术后适当休息，避免剧烈运动，有助于促进恢复。若出现持续疼痛、肿胀或其他不适，应及时就医评估。