复方硼砂含漱液的禁忌主要包含对硼砂或辅料过敏者禁用、孕妇及哺乳期妇女慎用、儿童须在成人监护下使用、口腔大面积破损者避免使用、肾功能不全者需谨慎。该药物为口腔黏膜消毒防腐剂，使用前建议咨询医生。
1、过敏禁用
对硼砂、薄荷脑或其他辅料过敏者禁止使用复方硼砂含漱液，否则可能引发口腔黏膜红肿、灼痛或皮疹等过敏反应。若用药后出现口唇麻木、舌体肿胀等表现，应立即停用并用清水漱口。过敏体质者使用前可小面积涂抹于手背皮肤测试反应。
2、孕妇慎用
孕妇及哺乳期妇女应在医生指导下谨慎使用。硼砂成分可能通过胎盘或乳汁影响胎儿及婴儿发育，尤其是妊娠早期需避免长期含漱。若必须使用，建议稀释后短期间断应用，并彻底漱净残留药液。
3、儿童监护
儿童须在成人监护下使用，防止误吞导致消化道刺激。6岁以下儿童不建议自行含漱，可改用棉签蘸取药液局部涂抹。误吞过量可能引起恶心、腹痛等症状，家长需将药品存放在儿童无法触及的位置。
4、黏膜破损
口腔存在大面积溃疡、糜烂或开放性伤口时禁用，硼砂可能延缓创面愈合并加重疼痛。仅适用于轻度牙龈炎或口炎，使用后若黏膜发白、脱皮需停药。外伤性口腔出血者应先止血再考虑局部消毒。
5、肾功能不全
严重肾功能不全者需避免长期使用，硼砂经肾脏代谢可能加重肾脏负担。使用期间应监测尿量与肾功能指标，出现少尿或水肿需及时就医。合并高血压或水肿患者可改用氯己定等不含硼砂的漱口液。
使用复方硼砂含漱液期间应避免进食辛辣刺激食物，保持口腔清洁。含漱时间不宜超过1分钟，每日使用不超过3次，连续用药一般不超过7天。若症状无改善或出现黏膜灼伤感、味觉异常等不良反应，应及时停用并就诊。储存时需避光密封，避免高温导致成分挥发失效。
