肛瘘通常无法单纯依靠药物治愈，主要治疗手段为手术治疗，药物仅用于缓解急性期症状或术前术后辅助，常用药物包括头孢克肟分散片、甲硝唑片、布洛芬缓释胶囊、高锰酸钾外用片、康复新液。
1、抗感染药
肛瘘多由肛腺感染引起，常伴有金黄色葡萄球菌或大肠杆菌等细菌感染，导致局部红肿热痛。头孢克肟分散片属于第三代头孢菌素，能有效抑制细菌细胞壁合成，适用于敏感菌引起的呼吸道、泌尿道及皮肤软组织感染。在肛瘘急性发作期或合并周围蜂窝织炎时，该药可帮助控制感染扩散，减轻炎症反应，为后续手术创造有利条件，但须在医生指导下使用，不可自行长期服用。
2、抗厌氧菌药
肛周环境潮湿且富含厌氧菌，肛瘘形成过程中常合并厌氧菌感染，加重组织坏死和脓液积聚。甲硝唑片对大多数厌氧菌具有强大杀灭作用，能干扰细菌代谢过程，阻断其生长繁殖。对于深部脓肿或复杂性肛瘘患者，联合使用甲硝唑片可增强抗菌效果，减少毒素产生，缓解疼痛与发热症状。该药需严格遵医嘱剂量服用，避免饮酒以防双硫仑样反应，孕妇及哺乳期妇女慎用。
3、镇痛消炎药
肛瘘患者常因炎症刺激神经末梢而出现剧烈疼痛，尤其在排便或坐立时加剧，影响日常生活质量。布洛芬缓释胶囊通过抑制前列腺素合成，发挥解热、镇痛、抗炎三重功效，可有效缓解中度至重度疼痛及局部肿胀。作为非甾体抗炎药，它不直接治疗肛瘘本源，但能显著改善患者舒适度，便于进行日常护理和术前准备。胃肠道溃疡患者应谨慎使用，必要时配合胃黏膜保护剂。
4、消毒清洗药
保持肛周清洁是防止肛瘘继发感染的重要措施，高锰酸钾外用片溶于水后形成弱氧化性溶液，具有广谱杀菌、收敛止痒作用。每日用稀释后的高锰酸钾溶液坐浴，可清除分泌物、坏死组织及粪便残留，降低局部细菌负荷，促进创面干燥愈合。此法适用于术前准备及术后换药期间，需注意浓度调配得当，避免灼伤皮肤黏膜，颜色呈淡粉色即可，切忌过浓。
5、促修复药
肛瘘病程较长者常伴局部组织损伤难愈，康复新液含有多种活性成分，能刺激肉芽组织生长，加速创面修复，改善微循环。该药可用于冲洗瘘管或湿敷患处，有助于清除腐肉、减少渗出、缩小瘘管口径，为手术切除提供更好视野和操作空间。虽不能根治肛瘘，但在围手术期应用可缩短恢复时间，降低复发风险。使用时应避免接触眼睛，过敏体质者首次使用前建议做皮试。
肛瘘一旦确诊，应及时前往正规医院肛肠科就诊，接受专业评估并制定个体化治疗方案，绝大多数患者需通过挂线疗法、瘘管切开术或肛瘘切除术等外科手段才能彻底治愈。日常生活中应注意饮食清淡，多吃蔬菜水果如菠菜、香蕉、苹果等富含膳食纤维的食物，保持大便通畅，避免久坐久站，养成定时排便习惯，便后用温水清洗会阴部，穿宽松透气内裤，适当进行提肛运动以增强盆底肌力，切勿盲目依赖药物延误病情。
