复方鱼腥草合剂具有清热解毒、消肿排脓、止咳化痰等功效，主要用于治疗风热感冒、急性咽炎、扁桃体炎等上呼吸道感染性疾病。
1、清热解毒
复方鱼腥草合剂所含鱼腥草、黄芩等成分能抑制多种病原微生物生长，有助于减轻发热、咽喉红肿等风热症状。对金黄色葡萄球菌、链球菌等引起的呼吸道感染尤为有效，常见临床用途为缓解急性咽炎伴随的灼热感。
2、消肿排脓
该药通过促进局部血液循环和淋巴回流，可改善扁桃体化脓性炎症导致的组织水肿。其中连翘苷等活性成分能加速炎性渗出物吸收，适用于扁桃体Ⅱ度以上肿大伴白色渗出物的患者。
3、止咳化痰
鱼腥草挥发油能松弛支气管平滑肌，桔梗皂苷则增强呼吸道黏膜纤毛运动，联合起到稀释痰液、促进排痰的作用。对于风热犯肺引起的干咳或黄黏痰效果明显，常见于急性支气管炎早期。
4、抗菌消炎
体外实验显示其能抑制流感病毒、腺病毒等呼吸道常见病原体复制，减少炎性因子释放。临床多用于病毒性感冒合并细菌感染的协同治疗，可缩短病程1-3天。
5、免疫调节
方中野菊花多糖可提升血清IgA水平，增强呼吸道局部免疫力。反复上呼吸道感染患者遵医嘱周期性使用，有助于降低复发概率。
使用期间应忌食辛辣刺激食物，避免降低药效。风热症状缓解后须及时停药，连续服用不宜超过7天。服药后出现皮疹、呼吸困难等过敏反应需立即就医。慢性病患者及孕妇使用前应咨询医师，不可与温补类中药同服。日常可配合饮用罗汉果茶辅助清热，咽喉不适时建议盐水漱口保持局部清洁。
