新生儿肺动脉高压治愈后多数不会遗留明显后遗症，少数患儿可能出现肺动脉发育异常或心肺功能受限。该疾病与胎儿期肺血管发育异常、围产期缺氧等因素相关，需通过定期随访评估恢复情况。
新生儿肺动脉高压治愈后，肺血管阻力通常可逐渐恢复正常，心脏结构及功能也能得到良好代偿。早期规范治疗可显著降低后遗症概率，多数患儿在成长过程中运动耐量与同龄儿童无异。临床随访数据显示，接受一氧化氮吸入、西地那非等靶向药物治疗的患儿，肺动脉压力多能在数月内趋于稳定，远期预后与发病严重程度及治疗时机密切相关。
部分重症患儿可能遗留肺动脉分支狭窄、右心室肥厚等结构异常，这类情况多见于合并先天性心脏病或治疗延迟的病例。极少数患儿可能出现运动后气促、生长迟缓等现象，需通过心脏超声、运动负荷试验等持续监测。若存在残余肺动脉高压，可能需要长期服用波生坦、安立生坦等靶向药物，并限制剧烈运动。
建议治愈后每3-6个月复查心脏超声，避免呼吸道感染诱发肺高压复发。日常注意观察喂养情况、体重增长及活动耐力，出现口唇青紫或呼吸急促应及时就医。母乳喂养有助于促进肺血管修复，补充维生素D可改善血管内皮功能，但需在医生指导下制定个体化康复方案。
